五粮液专卖店和旗舰店的区别如下：
1、店面要求不同：五粮液专卖店是厂家注册的，店内只能销售五粮液系列。厂家每年对专卖店都有一定的费用支持，与代理商水平相当。它可以直接从制造商那里购买商品，并用回扣完成销售，而不是用金钱。
旗舰店主要有三种建店模式，一是代理商建店，一般由产品的地区代理建立，如众多的服装品牌旗舰店；二是生产商直接建店，一般是总部授权，各地分公司承建，如某些IT通讯产品旗舰店；三是集成商建店，一般是同类产品集成商自己建店，如眼镜行业的旗舰店。
2、申请公司注册资本不同：五粮液专卖店的申请必须以公司名义进行，申请标准专卖店的公司注册资本不低于50万元，申请旗舰店的公司注册资本不低于50万元不到100万元。
3、不同流动性要求：标准专卖店营运资金不低于70万元，旗舰店营运资金不低于200万元。
4、线下零售系统不同，五粮液旗舰店包括实体店和app两个零售系统：消费者可以在app中下单，由附近的实体店配送。根据距离的不同，服务最快可在19分钟内送达。app除了提供在线订购服务外，还具有产品展示、品牌推广、消费者互动等功能。专卖店没有应用系统，只支持实体店销售。
5、服务内容不同：旗舰店有很多内容，专卖店只卖，旗舰店不仅卖，还有其他服务内容。
